根据《青海省玉树灾后重建运输保障方案》，玉树三年重建物资及生活物资运输总需求量巨大。为确保玉树灾后重建有力、有序、有效进行，省交通厅坚持优先通行、热情服务、规范管理的原则，对玉树灾后重建物资运输车辆开通专用通道，确保重建物资运输车辆和重建工作用车快速、优先、安全、免费通行我省收费公路。 
(一)明确免费车辆范围。一是运输玉树灾后重建物资并合法装载的货车、运送援建人员的客车；二是经省玉树重建现场指挥部批准的单位的工作用车；三是省玉树重建现场指挥部调派的支援运输车辆；四是交通运输部或省人民政府确定的其它抗震救灾车辆。 
(二)免费通行凭证。一是运输政府指令性重建物资的免费车辆，凭道路运输管理机构签发的货物运输“四联单”办理“青海玉树灾后重建物资运输车辆通行证”。该通行证实行“一车一证，随车运行，货证相符，趟次有效”管理。二是经省玉树重建现场指挥部批准的单位的工作用车、调派的支援运输车辆凭省玉树重建现场指挥部属意见的单位介绍信办理“青海玉树灾后重建工作车辆通行证”。
(三)持有免费通行凭证的车辆通过收费站时，应主动出示通行证，由收费人员核验确认后通行。对车证不符、货证不符的车辆或超过了规定的有效期的车辆，原则上不予免费通行。持有免费通行凭证但超限运输的车辆，必须据实交纳当次车辆通行费。
为了提前做好为玉树灾后重建运输车辆开通专用通道工作，省交通厅运输处提前着手制定运输车辆免征公路通行费管理细则、设计通行证样式和内容，并于5月15日印制了第一批次10万份的通行证备用。